分居三个月可以起诉离婚。我国公民依法享有离婚自由，夫妻双方如果分居问题造成感情破裂的，一方或者双方就可以就夫妻感情破裂为由向起诉离婚。审理后认定双方感情已经完全破裂，而且经调解已经没有和好可能的，会依法判决准予离婚。
一、女方想离婚可男方不愿意怎么办
夫妻一方提出离婚另一方不同意的，可以向起诉离婚。将依据婚姻基础和婚后感情、婚姻现状和离婚原因及有无和好可能等情况，来认定夫妻感情是否确已破裂。经调解程序后，如果婚姻关系确已破裂，最终会依法判决离婚。但是第一次起诉离婚，对方不同意，如果没有夫妻感情确已破裂的法定情形的话，一般不会判决离婚。
二、分居时间可以算结婚时间吗
（一）不管分居多久，婚姻关系都不会自动失效的，只有离婚之后婚姻关系才会解除。
离婚的方式有两种，协议离婚和诉讼离婚，协议离婚只要双方协商一致，对财产、子女抚养等问题达成一致意见即可，诉讼离婚则需要证明夫妻感情已经破裂。
如果诉讼离婚的，分居满两年的可以准予离婚。如果协议离婚的，不用分居就可以离婚。
如果是分居的公民想要诉讼离婚，应该具体看分居的原因和分居的时间，即必须是因感情不和引起分居，还有就是要分居满二年。这两个条件，是分居引起离婚所必须同时具备的。
（二）长期分居是可以起诉离婚的理由
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（1）重婚或者与他人同居；
（2）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（3）有、吸毒等恶习屡教不改；
（4）因感情不和分居满二年；
（5）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
