低申报被海关查获的处理方式如下：
1、纳税义务人不如实申报关税，故意报低关税，如果数额达到较大的，并且税额占应税额度达到10%以上的，就会构成逃税罪；
2、纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；
3、金数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
关税的分类大致被分为四类，具体如下：
1、将关税按照商品流向进行分类，其包含有进口关税、出口关税、过境关税；
2、将关税按照征税目的进行分类，其包含有财政关税、保护关税、惩罚关税或报复关税；
3、将关税按照待遇进行分类，其包含有普通关税、优惠关税，其中优惠关税又被细分为最惠国待遇关税和特定优惠关税以及普惠制关税；
4、将关税按照常规与临时进行分类，其包含有法定关税、附加关税。
法律条例《中华人民共和国刑法》第二百零一条
【逃税罪】纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
扣缴义务人采取前款所列手段，不缴或者少缴已扣、已收税款，数额较大的，依照前款的规定处罚。
对多次实施前两款行为，未经处理的，按照累计数额计算。
