应该赔偿部份免交契税，补差价部份按实际税率征收。1、被拆迁房屋的个人依照拆迁补偿安置协议取得货币补偿，重新购置一处房屋的（即货币补偿安置），购房成交价款中未超出拆迁补偿款的部份免征契税；超出拆迁补偿款部份，应按适应税率征税。2、被拆迁房屋的单位和个人依照拆迁补偿安置协议重新承受还建房屋（即房屋产权调换安置），不补缴产权调换差价款的，免征契税；应补缴产权调换差价的，对补缴款部份，按适用税率征收税。
法律依据：《中华人民共和国契税暂行条例》第六条第六条 有下列情形之一的，减征或者免征契税：（一）国家机关、事业单位、社会团体、军事单位承受土地、房屋用于办公、教学、医疗、科研和军事设施的，免征；（二）城镇职工按规定第一次购买公有住房的，免征；（三）因不可抗力灭失住房而重新购买住房的，酌情准予减征或者免征；（四）财政部规定的其他减征、免征契税的项目。
