农村合作医疗是按年缴费的，可以补缴。农村合作医疗是我国农民自己创造的医疗保障制度，在缓解农民因病致贫、因病返贫中发挥着极大的作用。农村合作医疗缴费机制为当年缴费，次年的1月1日才生效，次年可以进行医疗报销。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第二十条国家建立和完善新型农村社会养老保险制度。
新型农村社会养老保险实行个人缴费、集体补助和补贴相结合。
第二十一条新型农村社会养老保险待遇由基础养老金和个人账户养老金组成。
参加新型农村社会养老保险的农村居民，符合国家规定条件的，按月领取新型农村社会养老保险待遇。
