合法工时制度的：根据《劳动法》第三十六条，每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过44小时。根据第四十一条，经与工会和劳动者协商后，用人单位可以延长工作时间，但每日不得超过1小时，特殊情况下不得超过3小时，每月不得超过36小时。公司可申请不定时工作制和综合工时制，但总时长仍不能超过法定规定。
法律分析
1、不合法。
2、相关法条：《劳动法》第三十六条国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。第四十一条用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时;因特殊原因需要延长工作时间的在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。时制度。
3、合法的情况是公司申请了不定时工作制和综合工时制。但是按月或季度的总时长也不能超过上面法条的规定。
拓展延伸
劳动法对每天工作时间的是多少？
根据劳动法规定，一般情况下，每天工作时间的是8小时。然而，根据特定行业和工作性质的不同，工作时间的可以有所变化。例如，对于某些特殊行业或特殊岗位，劳动法允许延长工作时间，但同时要保证员工的休息和健康。此外，劳动法也规定了加班工作的条件和补偿标准，以保护员工的权益。因此，每天上班12小时是否合法需要具体参考劳动法的规定，并结合具体情况进行评估。如果您面临类似问题，建议咨询专业律师以获取确切的法律意见。
结语
根据劳动法规定，每日工作时间不得超过8小时，且每周工作时间不得超过44小时。特殊情况下，经工会和劳动者协商后，工作时间可适当延长，但每日不得超过1小时，每月不得超过36小时。因此，每天上班12小时是否合法需根据具体情况和劳动法规定评估。如有类似问题，建议咨询专业律师以获得确切的法律意见。
法律依据
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章 劳动合同的解除和终止 第四十五条 【劳动合同的逾期终止】劳动合同期满，有本法第四十二条规定情形之一的，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止。但是，本法第四十二条第二项规定丧失或者部分丧失劳动能力劳动者的劳动合同的终止，按照国家有关工伤保险的规定执行。
中华人民共和国职业病防治法（2018修正）：第三章 劳动过程中的防护与管理 第三十三条 用人单位与劳动者订立劳动合同（含聘用合同，下同）时，应当将工作过程中可能产生的职业病危害及其后果、职业病防护措施和待遇等如实告知劳动者，并在劳动合同中写明，不得隐瞒或者欺骗。
劳动者在已订立劳动合同期间因工作岗位或者工作内容变更，从事与所订立劳动合同中未告知的存在职业病危害的作业时，用人单位应当依照前款规定，向劳动者履行如实告知的义务，并协商变更原劳动合同相关条款。
用人单位违反前两款规定的，劳动者有权拒绝从事存在职业病危害的作业，用人单位不得因此解除与劳动者所订立的劳动合同。
中华人民共和国劳动法（2018修正）：第十二章 法律责任 第九十三条 用人单位强令劳动者违章冒险作业，发生重大伤亡事故，造成严重后果的，对责任人员依法追究刑事责任。
